COMPITO DI BIOCHIMICA

b)    Ad un valore di pH uguale al pI, una proteina sottoposta ad un esperimento di elettroforesi non si muove nel campo e 343h75d lettrico.

c) Una proteina acida ha un pI maggiore di 7

d)    Una proteina basica ha un pI maggiore di 7

Esaminate i 4 amminoacidi seguenti.

Indicate quale dei seguenti aminoacidi sono associati alle seguenti proprietà.

a) Catena laterale alifatica

b)    Catena laterale basica

c) Tre gruppi ionizzabili

d)    Carica di +1 a pH 7,0

e) pK ~10 in proteine

f)  gruppo amminico secondario

AMINOACIDI

A) PROLINA B) TIROSINA C) LEUCINA D) LISINA

Scrivete la struttura della cisteina a pH 1

Accoppiate gli aminoacidi riportati nella colonna di sinistra con le catene laterali appropriate nella colonna di destra.

a) Lys____ 1) Alifatica non polare

b)    Glu____    2) Aromatica non polare

c) Leu____ 3) Basica

d)    Cys____ 4) Acida

e) Trp____ 5) Contenente un gruppo

f)  Ser____ sulfidrilico

6) Contenente un gruppo

ossidrilico

Quali dei seguenti aminoacidi hanno catene laterali che sono cariche negativamente in condizioni fisiologiche (cioè vicino a pH 7)?

a) Asp

b)    His

c) Trp

d)    Glu

e) Cys

Perché l'istidina si comporta come un tampone a pH 6.0?Cosa potete dire sul potere tamponante dell'istidina a pH 7,6?

Correlate tutte le caratteristiche appropriate, riportata nella colonna di destra, delle interazioni e dei legami elencati nella colonna di sinistra.

a) L'interazione elettrostatica ______ 1) richiede specie non polari

b)    Il legame idrogeno______ 2) implica solo specie cariche

c) Il legame di Van Der Waals______  3) richiede specie polari

d)    L'interazione idrofobica______ 4) implica atomi di ossigeno

e idrogeno, o di azoto e idrogeno

5) implica atomi non specifici

6) è anche detto ponte salino

7)esiste solo in acqua

8)è ottimale alla distanza di

contatto di van der waals.

9)ha un'energia compresa tra

3 e 7 Kcal/mole.

10) ha un energia di circa 1

11) si indebolisce in acqua

Le proprietà dell'acqua comprendono:

a) La capacità di formare legami idrogeno con altre molecole d'acqua 

b)    Una struttura disordinata allo stato liquido

c) Una bassa costanre dielettrica

d)    L'esistenza di un forte dipolo, con la carica negativa sull'atomo di ossigeno.

e) Un diametro di 5 A°

Quali delle seguenti affermazioni relative al legame peptidico sono esatte?

a)      il legame peptidico è planare per il carattere di parziale doppio legame che   unisce l'atomo di C del carbonile e l'atomo di azoto.

b)     Esiste un relativo grado di libertà di rotazione del legame tra il C del carbonile e l'atomo di azoto.

c)      L'idrogeno legato all'atomo di azoto è in posizione trans rispetto all'atomo di ossigeno del gruppo carbonilico.

d)     Non esiste libertà di rotazione intorno al legame tra il carbonio α e l'atomo di C del carbonile

la struttura in α-elica:

a) è mantenuta da legami idrogeno tra le catene laterali degli aminoacidi.

b)    È rappresentata con la stessa percentuale in tutte le proteine.

c) Può assolvere a funzioni di supporto meccanico formando rigidi fasci di fibre in alcune proteine.

d)    È stabilizzata da legami idrogeno tra i gruppi amidici ed i gruppi carbonilici sulla catena polipeptidica principale.

e) Include tutti e 20 aminoacidi con la stessa frequenza.

Quali delle seguenti proprietà sono comuni alla α-elica ed alla β struttura nelle proteine?

a) forma a bastoncino

b)    legami H tra i gruppi CO ed NH sulla catena principale

c) distanza assiale tra due aminoacidi adiacenti di 3,5 A.

d)    numeri variabili di residui di aminoacidi partecipanti.

Spiegate perché l' α-elica e la β struttura si trovano frequentemente all'interno di proteine solubili in acqua.

Quale dei seguenti aminoacidi possono alterare la direzione di una catena polipeptidica ed interrompere l'α-elica?

a) phe

b)    cys

c) trp

d)    his

e) pro

Accoppiate i livelli di struttura delle proteine riportati nella colonna di sinistra con le appropriate descrizioni nella colonna di destra.

a) Primaria 1) Associazione tra le subunità delle proteine

b) Secondaria 2) Aggregati di α-elica e β struttura

c) supersecondaria 3) sequenza lineare di aminoacidi

d) terziaria  4) Disposizione nello spazio degli aminoacidi adiacenti

in una sequenza lineare

Quando la maggior parte delle proteine sono esposte a pH acido (es. pH 2), perdono attività biologica. Spiegate perché.

scrivete la formula di struttura del seguente peptide:

-Cys-Asp-Ala-Gly-Asn-